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Cerchi lavoro in ambito scientifico? Ti proponiamo alcuni dei principali motori di ricerca, completamente gratuiti, a cui far riferimento:
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Sei un Professionista del settore e cerchi un particolare strumento che possa esserti d'aiuto? Sei nel posto giusto: questo è lo spazio dedicato a te!
Ecco alcune delle nostre proposte:
- PhET: Simulazioni gratuite online di fisica, chimica, biologia e scienze della Terra (colorado.edu)
Simulazioni interattive per Scienze e Matematica - DuctApe, genomics and phenomics made easy (combogenomics.github.io)
Lo scopo finale del programma è quello di combinare le informazioni genomiche con i risultati degli esperimenti fenomici (Phenotype Microarrays) ed evidenziare i geni che possono essere responsabili delle variazioni fenotipiche. - BLAST: Basic Local Alignment Search Tool (nih.gov)
Utile per la ricerca di somiglianze tra sequenze biologiche. - National Center for Biotechnology Information (nih.gov)
Principale piattaforma a cui fare riferimento per l'accesso ad informazioni biomediche e genomiche. - Biopython · Biopython ·
Insieme di strumenti liberamente disponibili per il calcolo biologico realizzati in linguaggio Python. - RCSB PDB: Homepage
Fornisce l'accesso a strumenti per l'esplorazione, la visualizzazione e l'analisi di Strutture 3D nella banca dati delle proteine (ProteinDataBank). - FR3D · (bgsu.edu)
"Find RNA 3D": sviluppato per trovare piccoli motivi di RNA (da due a 20 nucleotidi) nelle strutture 3D dell'RNA. - Sfold - Software for Statistical Folding and Studies of Regulatory RNAs (wadsworth.org)
Software per il ripiegamento statistico degli acidi nucleici e studi sugli RNA regolatori. - BionanoMetaserver (uw.edu.pl)
Tool automatico per analizzare le strutture tridimensionali delle molecole di RNA e DNA. - ExPASy - ENZYME
Database per la nomenclatura enzimatica basato sulle raccomandazioni dell'IUBMB. - Mol* (molstar.org)
Visualizzazione dati molecolari - SubtiWiki (uni-goettingen.de)
Database relativo a B. subtilis - Home (megasoftware.net)
Suite per l'analisi dei dati di sequenza di DNA e proteine riferiti a specie e popolazioni. - JGI GOLD | Home (doe.gov)
Accesso completo alle informazioni riguardanti i progetti di sequenziamento del genoma e metagenoma. - Welcome to GROMACS — GROMACS webpage https://www.gromacs.org documentation
Software gratuito per la dinamica molecolare ad alte prestazioni e l'analisi dell'output. - Rat Genome Database (mcw.edu)
Raccolta di dati genetici, genomici, fenotipici e di malattia associati alla ricerca sui ratti. Fornisce l'accesso ai dati corrispondenti per altre otto specie e consente anche il confronto tra loro. La cura dei dati avviene sia manualmente che tramite una sistema automatizzato. - MGI-Mouse Genome Informatics-The international database resource for the laboratory mouse (jax.org)
Risorsa internazionale per il topo da laboratorio in cui vi sono dati genetici, genomici e biologici integrati per facilitare lo studio della salute e delle malattie umane. I dati includono caratterizzazione genica, nomenclatura, mappatura, omologie geniche tra mammiferi, collegamenti di sequenza, fenotipi, varianti alleliche, mutanti e dati di ceppo. - INFRAFRONTIER - The European infrastructure for phenotyping and archiving of model mammalian genomes
European Mouse Mutant Archive (EMMA). Archivio senza scopo di lucro per la raccolta tramite crioconservazione e la distribuzione di ceppi mutanti rilevanti essenziali per la ricerca biomedica di base. - GPMDB design home (thegpm.org)
Global Proteome Machine Database (gpmDB). Contiene la quantità minima di informazioni necessarie per analisi comuni relative alla bioinformatica, come la convalida di sequenze. È stato anche creato come supporto nel processo di analisi degli spettri MS / MS peptidici. La maggior parte dei dati è contenuta in un insieme di file XML. - Mycobank
Piattaforma nata per documentare nuovi nomi micologici, combinazioni e dati associati alla comunità micologica. Sono disponibili allineamenti di sequenze a coppie e dati di identificazione di funghi e lieviti. - NeuroMorpho.Org - a centrally curated inventory of digitally reconstructed neurons and glia
Si ritrovano modelli 3D di neuroni ricostruiti digitalmente. L'obiettivo è quello di fornire dati di ricostruzione e modelli da sfruttare nell'ambito delle neuroscienze. - What is dbEST? (nih.gov)
dbEST contiene dati di sequenza e altre informazioni sulle sequenze di cDNA "single-pass", o "Expressed Sequence Tag", da un certo numero di organismi - Home - SNP - NCBI
DbSNP contiene variazioni di singoli nucleotidi umani, microsatelliti e inserzioni e delezioni su piccola scala insieme a pubblicazione, frequenza di popolazione, conseguenze molecolari e informazioni di mappatura genomica e RefSeq sia per le variazioni comuni che per le mutazioni cliniche. - NCBI - Gone (nih.gov)
Database per sonde. Registro pubblico di reagenti di acidi nucleici progettato per raccogliere informazioni sui distributori di reagenti, sull'efficacia della sonda e sulle somiglianze di sequenza. - VEuPathDB
L'Eukaryotic Pathogen, Vector and Host Informatics Resource (VEuPathDB). Il portale offre un punto di raccolta per varie risorse su patogeni eucariotici e su vettori invertebrati di malattie infettive. Inoltre, consente di sfruttare l'ortologia per le ricerche tra generi. - BioModels (ebi.ac.uk)
Repository di modelli computazionali di processi biologici. Consente di cercare e recuperare modelli matematici pubblicati in letteratura. Alcuni modelli sono curati manualmente (per garantire la riproducibilità) e collegati alle informazioni di riferimento disponibili pubblicamente.